MySQL Workbench je z oficialniho webu ke stazeni pro Ubuntu 12.04 (LTS) a pro nejnovejsi verzi 13,10. Instalace na verzi mezi temito dvema se nedari kvuli nesplnenym zavislostem.
Verze pro Ubuntu 13.10 ma hodne neslnenych zavislosti, proto je nutne stahnout verzi pro Ubuntu 12.04. U te je nesplnena zavislost pouze na balicku libctemplate0. V novych verzich Ubutnu uz z me neznamych duvodu neni, nastesti lze rucne nainstalovat verzi ze starsiho Ubuntu. Zde jsou prime odkazy na stazeni: i386 a amd64.
Po jeho instalci uz staci normalne nainstalovat MySQL Workbench a vse by melo fungovat.